El inmueble data de finales del siglo XVII y principios del XVIII, fue hogar de los hermanos Serdán Alatriste: Carmen, Natalia, Máximo y Aquiles; iniciador del movimiento libertario, quienes se adhirieron al movimiento antirreeleccionista encabezado por Francisco I. Madero. La conjura fue descubierta por la policía y en esta casa se desarrolló la batalla inicial de la revolución maderista en 1910. En 1960, durante la administración del presidente Adolfo López Mateos, la casa fue adquirida por la federación y transformada enl museo. Abrió sus puertas el 18 de noviembre de 1960.