El museo cuenta con un área de 2200 metros cuadrados, alberga una colección de 174 piezas, provenientes en comodato de la Secretaría de la Defensa Nacional (SEDENA), donaciones de particulares e instituciones diversas, las cuales exponen en un recorrido de 14 salas permanentes y una dedicada a exposiciones temporales, la historia militar, desde la época prehispánica hasta la actualidad. Entre los temas presentados se encuentran: Historia del conjunto arquitectónico del Antiguo colegio de San Francisco Xavier, el Guerrero Prehispánico y la Conquista, las Milicias Virreinales, el Movimiento de Independencia, el Ejército Liberal, la Revolución y el nacimiento del ejército mexicano, militares poblanos; vida y obra de Ignacio Zaragoza, la participación de la mujer y del menor de edad en las fuerzas armadas de México y el ejército en los siglos XX y XXI.